犏牛、黃牛和娟姍牛瘤胃菌群結構比較及功能預測研究

【摘要】：【目的】分析犏牛、黃牛和娟姍牛瘤胃微生物多樣性的差異,并對菌群功能進行預測?！痉椒ā窟x取甘南藏族自治州合作市同一牧場放養的生理狀態正常、年齡相近(1.5歲左右)的犏牛、黃牛和娟姍牛各6頭,抽取瘤胃液于凍存管,放入液氮保存?；?6Sr RNA測序技術,對供試牛瘤胃液樣本基因組DNA進行V3～V4區擴增及測序,對所得序列處理后進行OTU聚類分析和物種分類,并利用Tax4Fun對菌落的16S r RNA基因序列進行KEGG功能注釋?！窘Y果】Alpha多樣性分析顯示,犏牛瘤胃微生物多樣性和豐富度顯著高于黃牛和娟姍牛(P0.05)。門分類水平上,犏牛瘤胃液中厚壁菌門、脫硫桿菌門、疣微菌門、髕骨細菌門和纖維菌門顯著高于黃牛(P0.05),脫硫桿菌門和疣微菌門顯著高于娟姍牛(P0.05)。屬分類水平上的差異主要表現在厚壁菌門與擬桿菌門所屬的各菌群中,犏牛瘤胃液中普雷沃菌屬、瘤胃球菌屬和解琥珀酸菌屬豐度顯著低于黃牛(P0.05);理研菌科＿RC9菌群豐度顯著高于黃牛(P0.05);犏牛和娟姍牛瘤胃中克里斯氏菌科＿R-7菌群、瘤胃菌科＿NK4A214菌群、g＿norank＿f＿UCG-011和未分類毛螺菌科顯著高于黃牛(P0.05)。瘤胃菌群功能預測發現,犏牛富集在碳水化合物代謝、核苷酸代謝和翻譯二級通路上的功能豐度顯著高于黃牛(P0.05),但與娟姍牛差異不顯著(P0.05);黃牛二級通路中輔助因子和維生素的代謝功能豐度顯著高于犏牛和娟姍牛(P0.05)?！窘Y論】犏牛和黃牛間瘤胃菌群組成差異較大,娟姍牛菌群組成介于犏牛和黃牛之間;犏牛瘤胃菌群發酵最具優勢,可能為其適應高原地區嚴酷的生存環境發揮了重要作用。